Wilhelm Kanschat wurde am 10. Februar 1899 in Schikschny in Litauen geboren.

Er trat 1916 in das Stephansstift in Hannover ein, wurde Ostern 1920 in das Missionsseminar aufgenommen und bestand im Frühjahr 1926 das Abgangsexamen. Anschließend wurde er Lehrvikar in Oberbobritzsch. Er besuchte das College Kingsmead in England.

Am 26. September 1926 wurde er in Freiburg ordiniert und am 24. Oktober 1926 nach Südindien (heute Tamil Nadu) abgeordnet.

Kanschat landete am 19. November 1926 in Colombo. Er ging zu Sprachstudien nach Kodaikanal und wurde dann in Pandur stationiert. Nach sechs Monaten wurde er nach Tranquebar (heute Tharangambadi) versetzt.

Er war der letzte Missionar an dem historischen Ort der ersten deutschen protestantischen Mission, die Missionar Ziegenbalg 1706 begründet hatte.

Kanschat heiratete am 27. November 1928 die schwedische Missionarslehrerin Aina Malmeström.

1933 musste er krankheitshalber Indien verlassen. Er war einige Zeit in Schweden und kehrte dann nach Deutschland zurück. Hier meldete er sich, weil er noch nicht wieder tropenfähig war, Anfang 1934 in Dresden zum theologischen Examen. Er wurde später Pfarrer in Dobra bei Königsbrück, 1942 Pfarrer in Erla-Crandorf im Erzgebirge, 1955 Pfarrer in Schwarzenberg.

Wilhelm Kanschat verstarb am 3. Februar 1980.