Alfred Winkler wurde am 12. Dezember 1899 in Kaufungen, Sachsen als Sohn eines Schmiedemeisters geboren. Er besuchte die Volksschule und bildete sich durch Selbstunterricht weiter.

Ostern 1919 trat Winkler in das Leipziger Missionsseminar ein, wo er Ostern 1925 das Abgangsexamen bestand. Anschließend war er ein halbes Jahr Lehrvikar in Fünfbronn.

Winkler absolvierte einen medizinischen Kursus in Tübingen und einen Englisch-Sprachkurs in Kingsmead in England. Seine Ordination fand am 17. Oktober 1926 in Kaufungen statt.

Am 24. Oktober 1926 wurde er nach Deutschostafrika (heute Tansania) abgeordnet. Er heiratete am 2. November 1926 in Königsfeld Martha Müller, die Tochter des Pfarrers und ehemaligen Missionars Müller.

Winkler landete am 19. Dezember 1926 in Tanga und wurde in Masama stationiert. Im Juni 1935 traf er auf Heimaturlaub in Deutschland ein. Nach dem Zweiten Weltkrieg verblieb er in Paarl in Südafrika.

Alfred Winkler verstarb am 22. April 1965 in Kapstadt.