Charlotte Rother wurde am 3. Dezember 1906 in Gonja, Ostafrika, als Tochter des Missionars Paul Rother geboren, der dort seit dem Jahr 1901 seinen Dienst verrichtete. Ihr Bruder ist Missionar Rudolf Rother.

Sie erhielt in Glauchau ihre Erziehung. Am 10. Januar 1927 trat sie in den Ausbildungskursus im Missionsdienst ein, welchen sie am 10. Juni 1927 abschloss. 

Rother wurde am 23. Oktober 1927 nach Ostafrika abgeordnet und erreichte Tanga am 3. Dezember 1927. Sie wurde dann in Madschame (heute Machame) bei Senior Raum als Bürohilfe eingesetzt und war außerdem in der Krankenpflege tätig.

1929 verlobte sie sich mit Ernst Brandmüller aus Vereenigung bei Johannesburg, Südafrika, und erhielt daraufhin zum 1. November 1929 ihre Entlassung aus dem Missionsdienst.