Christian Wagner wurde am 4. März 1887 in Westheim bei Haßfurt in Unterfranken als Sohn eines Landwirts geboren. Er erhielt seine Ausbildung zum Lehrer in der Präparandenschule zu Marktsteft und im Lehrerseminar in Altdorf. Nach der Erfüllung seiner Militärpflicht war er drei Jahre als Lehrer in Winterhausen bei Würzburg tätig.

Am 1. Januar 1911 trat er in das Missionsseminar ein. Er bestand Ostern 1913 das Abgangsexamen, wurde am Sonntag Quasimodogeniti 1913 in Leipzig ordiniert. Danach war er sechs Monate in Edinburgh zur weiteren Ausbildung in der englischen Sprache. Am 12. Oktober 1913 wurde er nach Südindien abgeordnet.

Dort traf er am 21. November 1913 in Colombo und am 29. November 1913 dann in Madras (heute Chennai) ein. Bis März 1914 ging er in die Sprachschule in Bangalore. Von März 1914 bis März 1915 wirkte er in Erukatantscheri, von März bis September 1915 dann in Tanjore (heute Thanjavur).

Nach Ausbruch des Ersten Weltkrieges kam er Ende September 1915 in das Gefangenenlager Ahmednagar. Im Frühjahr 1916 wurde er mit der zweiten „Golconde“ heimbefördert. Seit dem Jahr 1916 war er als Stadtvikar in Bamberg tätig. Am 6. September 1916 heiratete er die bayerische Pfarrerstochter Emma Bock.

Christian Wagner starb am 24. November 1921 im Tropen-Genesungsheim zu Tübingen.