Günther Säuberlich wurde am 20. Juli 1864 in Kleinliebringen (Schwarzburg-Rudolstadt) geboren, wo sein Vater Kantor und Lehrer war. Er besuchte die Volksschule und das Gymnasium in Rudolstadt.

1882 bestand Säuberlich die Aufnahmeprüfung für ein Lehrerseminar, wurde aber wegen zu großen Andrangs und als Nichtpreuße nicht aufgenommen.

Daraufhin war er als Hilfslehrer tätig und trat 1885 in das Missionsseminar in Neuendettelsau ein. 1888 bestand er die Abgangsprüfung und wurde am 29. Juli 1888 in Hersbruck ordiniert und in die Kambamission nach Ostafrika (heute Kenia) abgeordnet.

Bis Januar 1891 war er in Mbungu, dann gründete er im Februar 1891 zusammen mit Missionar Niedermeier die Station Ikutha.

Säuberlich heiratete am 8. Juni 1897 in Deutschland Elise Mohr aus Schwarza. Er war von 1897 bis 1899 in Mbungu und Ikutha tätig und gründete mit Missionar Fickert im Mai 1899 die Station Mulango.

Im Jahr 1914 wurde er nach einem Heimaturlaub und Ausbruch des Ersten Weltkrieges an der Wiederausreise gehindert und leistete während des Krieges Aushilfsdienste als Lehrer.

1917 siedelte er zur Leitung des Missionsverlags nach Leipzig über. Nach Kriegsende war er, bis zu seiner Pensionierung im Jahr 1934, als Werbearbeiter der Mission und im Sekretariat tätig.

Günther Säuberlich verstarb am 6. Juli 1946.