Johann Friedrich Meischel wurde am 10. Februar 1812 in Augsburg als Sohn eines Töpfermeisters geboren. Er war selbst zunächst als Töpfer tätig.

Dann trat er in das Basler Missionsseminar ein und wurde 1846 an die Goldküste Australiens ausgesandt. Er arbeitete dort bis zum Jahr 1850, musste später aufgrund von Fieberkrankheit in die Heimat zurückkehren. Daraufhin trat er aus der Basler Mission aus und stattdessen 1851 in den Dienst der Breslauer Synode und wurde Pastor der lutherischen Gemeinde in Düsseldorf.

Als er keine Erlaubnis mehr erhielt, in Preußen zu bleiben, meldete er sich im November 1852 in Leipzig zum Missionsdienst in Indien und wurde am 30. August 1853 zusammen mit Missionar Baierlein in der Leipziger Johanniskirche abgeordnet.

Er reiste um das Kap der guten Hoffnung, war insgesamt 167 Tage auf See und landete mit Frau und Kind schließlich am 31. März 1854 in Madras (heute Chennai). Am 1. März 1856 übernahm er eigenständig die Station Kumbakonam.

Im Streit um die Anerkennung des indischen Kastenwesens trat er auf die Seite von Missionar Ochs. Darauf verließ er im Oktober 1859 Indien, um in Australien eine Pfarrstelle an einer deutschen lutherischen Gemeinde anzunehmen.

Johann Friedrich Meischel starb im März 1883 in Rosenthal in Südaustralien.