Karl Kannegießer wurde am 8. März 1909 in Madras (heute Chennai) in Indien als Sohn von Missionar Georg Kannegießer geboren. Er lernte schon zu Hause am Esstisch Tamil, die Sprache der Einheimischen, weil der Vater darauf bestand.

In der Heimat lernte er Tropenlandwirtschaft in Witzenhausen, um in Indien den landwirtschaftlichen Missionsdienst übernehmen zu können. Dort lernte er auch seine Frau kennen. 1930 bestand er das Diplomexamen.

Danach arbeitete er noch ein Semester in den Werkstätten der Anstalt und ging dann im Winter 1930/31 in das Leipziger Missionsseminar, wo er theologisch ausgebildet wurde. Außerdem war er am Institut für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung der Universität Leipzig.

Kannegießer wurde am 6. Januar 1932 in der Diakonissenhauskirche in Dresden als Missionslandwirt nach Indien abgeordnet. Er landete am 22. Februar 1932 in Colombo und wurde in Pandur zur Verwaltung der Laudereien stationiert.

Am 2. Mai 1934 heiratete er schließlich Auguste Huhn in Madras.

In Pandur hat er mit großem Fleiß die Bestellung der Reisfelder vorangebracht. Nach dem Krieg übernahm er im Dienst der Inneren Mission einen landwirtschaftlichen Gutsbetrieb.

Karl Kannegießer verstarb am 12. Mai 1985.