Johannes Schanz wurde am 12. Mai 1876 in Bobenneukirchen im Vogtland als fünfter Sohn des Pastors und Indienmissionars Hugo Schanz geboren. Durch seinen Vater kam er früh mit dem Thema Mission in Kontakt.

Schanz absolvierte das Gymnasium in Hof 1895 und studierte dann von 1895 bis 1899 in Erlangen, Greifswald und Leipzig Theologie. Anfang 1901 trat er in das Leipziger Missionshaus ein.

Durch Begegnungen beim Missionsfest in Greifswald wurde er noch einmal in seiner Absicht in den Missionsdienst zu gehen bestärkt. Seine Ordination fand am 16. Mai 1901 in Meißen statt.

Am 29. Mai 1901 wurde Schanz dann in die Dschaggamission nach Deutschostafrika (heute Tansania) abgeordnet, wo er am 14. August 1901 in Moschi (Old Moshi / Alt-Moshi, heute Kidia) ankam.

Er siedelte am 12. Januar 1904 nach Mamba über, um im April die Station von Missionar Althaus zu übernehmen. 1905 wurde er nach Moschi versetzt. Diese Station übergab er am 1. August 1910 an Missionar Gutmann, da er krankheitsbedingt in Heimaturlaub gehen musste.

Schanz kam am 9. Oktober 1910 in Leipzig an. 1912 schied er aus dem Missionsdienst aus, weil er nicht mehr tropenfähig war und trat in den sächsischen Pfarrdienst. 1936 wurde er emeritiert.

Johannes Schanz ist am 30. Januar 1963 im Altersheim Grimma Hohnstädt heimgegangen.